http://www.backlog.jp/index.html BTS というか Issue Tracking System の類。デモを見る限りなかなかとっつき易そう、という感じがする。それ以上に、動いているデモが見られるのがいいですね。
Flash ファイルを生成しているのは Wink (http://www.debugmode.com/wink/) というプログラムらしい。Windows と Linux で動くフリーウェア。商用で同等のソフトウェアとしては Macromedia Captivate がある、らしい。